反渗透膜只能允许水分子和极少离子态矿物质通过，只从水质角度来说，反渗透膜出水是最干净的。但其出水量较小（产生“废水”多），且一些人体所需的矿物质也被过滤掉了。因此，如果自来水的硬度（即通常我们看到的水垢）较高，可以考虑用纳滤或反渗透的净水器；但如果水质硬度不高，则用超滤即可满足日常需求。

　　不过净水器仅能物理截留微生物而不能杀灭，因此，若使用不当，净水器也可能变成“细菌定时炸弹”，会造成饮用水的二次污染。